19世紀末、ロシア帝国は中央アジアへの積極的な進出を開始し、キルギスの領土を徐々にトルキスタン地方に編入していった。現地住民の抵抗は鎮圧されたが、とりわけ悲劇的だったのは1916年の反乱(ウルクン)であり、その際、数万人のキルギス人が中国へ逃れることを余儀なくされた。
革命後、キルギスタンはソ連の一部となった:
- 1924年 — 自治州
- 1936年以降 — キルギス・ソビエト社会主義共和国
ソビエト時代は工業化、都市化、教育改革をもたらしたが、同時に強制的な集団化、イスラム教や遊牧生活への弾圧、そして民族的アイデンティティの抑圧ももたらした。
遊牧民は村へ移住させられ、ユルトはコンクリートの建物に取って代わられ、公の場ではロシア語が徐々にキルギス語に取って代わっていった。しかし、こうした状況下であっても、民族的自覚は失われることはなかった。